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清华大学谢震Nature子刊:控制Cas9活性的新策略

中医世家 2024-05-28 18:54:19

2016年10月15日讯 使用人工合成的基因线路,对dCas9功能进行可编程的和精确的调控,以响应多个分子信号,将扩大CRISPR-Cas技术的应用范围。然而,由于现有病毒传递载体的包装限制,CRISPR-Cas治疗性基因回路的应用仍然是一种挑战。

10月3日,清华信息科学与技术国家实验室谢震课题组在《Nature Communications》发表了题为“Integration and exchange of split dCas9 domains for transcriptional controls in mammalian cells”的研究论文,首次报道了在哺乳动物细胞中,通过合理拆分Cas9/dCas9蛋白,利用多输入合成基因线路感知不同分子信号,实现了在不同类型细胞中对Cas9/dCas9活性的精确调控,为精确控制CRISPR/Cas9基因编辑工具提供了新的策略。

CRISPR/Cas9系统是细菌和古细菌在长期演化过程中形成的一种适应性免疫防御,可用来对抗入侵的病毒及外源DNA。CRISPR/Cas9系统通过将入侵噬菌体和质粒DNA的片段整合到 CRISPR中,并利用相应的CRISPR RNAs(crRNAs)来指导剪切与之配对的DNA序列。通过人工设计包含Cas9结合靶点序列的指导RNA(guide RNA),Cas9可用于对基因组中特异位点的切割。不仅如此,失去核酸酶活性的dCas9也可用于基因表达调控,以及DNA位点的标记。精确控制Cas9/dCas9的功能,有助于实现特定时间、特定细胞的表达,进一步拓展CRISPR/Cas系统的应用范围。

在该项研究中,课题组首先验证了利用内含肽拆分Cas9/dCas9的可行性,并实现了基于拆分dCas9的三输入逻辑“与门”基因线路。此外,课题组还利用TALE互抑制基因线路,通过感应shRNA或细胞特异性microRNA信号,实现了拆分dCas9的结构域互换,控制单个或两个不同基因的表达。该研究发展的基于内含肽拆分dCas9的结构域整合、交换策略,不仅为拆分Cas9突破基因治疗载体装载容量限制提供了新的策略,也为特异性控制dCas9活性提供了新型工具。

谢震课题组致力于合成生物学基因线路在生物学和医学上的应用。其开发的结构域可控交换策略特异性控制dCas9功能,是该课题组继2015年在《Nature Chemical Biology》报道利用TALE转录抑制子模块化拼装合成基因线路之后,对合成生物学领域的又一重要贡献。

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